202311月,苏州大学苏州医学院澳门银银河4936周哲敏教授团队在国际期刊 Nature Communications 在线发表题为“Distributed genotyping and clustering of Neisseria strains reveals continual emergence of epidemic meningococcus over a century”的研究论文。


     奈瑟氏菌包括脑膜炎奈瑟氏菌和淋病奈瑟氏菌两种致­病菌,每年导致约9000万次感染,特别脑膜炎奈瑟氏菌曾多次引起全球大流行。基于基因组学的全球病原体监控对传染病防治起关键作用,可在疾病暴发早期快速明确病原体来源和传播风险。周哲敏教授课题组开发分布式cgMLST算法(dcgMLST),整合149个苏州地区菌株和全球69,994个菌株,将奈瑟氏菌划分为39个物种,其中包括10个新发现物种。脑膜炎奈瑟氏菌被进一步分为168个地方谱系和3个大流行谱系。大流行谱系包括两个A血清群谱系和近期流行的W135谱系,三者在过去的百年中在全球造成至少9次大规模流行。采用全新生信技术,对包含3个大流行谱系分别进行群体遗传学分析,首次系统重建了过去百年间流脑的全球传播模式,明确了我国流脑暴发和国际流行之间的密切关联。依此提出全新的脑膜炎奈瑟氏菌流行模型,将其从地方谱系逐步演化形成大流行谱系并逐渐消亡的过程分为6个阶段,并总结各阶段特征。最后,周哲敏教授课题组采用dcgMLST对苏州的5次独立流脑暴发进行分析,发现传统流行病学分析极大高估了流脑病原体的传播次数,而基于高分辨率分析可以准确区分直接传播事件和密接人群本身的携带菌株。

 

      苏州大学苏州医学院澳门银银河4936硕士研究生钟岭、苏州市疾病预防控制中心张梦寒、苏州市立医院孙利兵为该论文第一作者,苏州大学苏州医学院澳门银银河4936周哲敏教授、李恒博士和苏州市疾病预防控制中心詹亚蕙研究员为论文通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金、江苏省自然科学基金、苏州市重大疾病和传染病防控关键技术研究计划以及苏州市医学重点学科建设项目、江苏省研究生科研创新计划等项目支持。

 

文章链接:https://www.nature.com/articles/s41467-023-43528-0